鸭呼肠孤病毒的分子鉴定
张大丙 教授
鸭“脾坏死病”对我国肉鸭产业已经造成巨大危害。为进一步确定鸭“脾坏死病”的病原,本试验对来自北京、河北、江苏、河南的4株樱桃谷北京鸭源鸭呼肠孤病毒(Duck reovirus,DRV)进行了分子鉴定。利用GenBank中番鸭源DRV的σA基因和σNS基因序列合成2对引物,分别提取4株病毒的RNA作为模板,依次进行RT-PCR扩增、产物回收、克隆、测序和序列分析。
电泳结果:从4株DRV中均扩增出1131和1065 bp的条带;BLASTP结果:扩增产物序列均为呼肠孤病毒的特征序列,1131 bp序列编码内衣壳蛋白σA,1065 bp序列编码非结构蛋白σNS;CLUSTALW结果:樱桃谷北京鸭源和番鸭源DRV之间σA和σNS基因的核苷酸序列同源性分别为89%~94%和83%~84%。与之相比,樱桃谷北京鸭源与鸡源呼肠孤病毒σA和σNS基因的核苷酸序列同源性较低。
结合其他研究结果进行分析:DRV是鸭“脾坏死病”的病原,樱桃谷北京鸭源与番鸭源DRV具有相近的遗传进化关系。


