雏鸭肝炎消减cDNA文库的构建及差异基因筛选
陈国宏教授 徐琪 博士
I型鸭病毒性肝炎(duckling viral hepatitis,DVH),是由雏鸭肝炎病毒引起的一种传播迅速、发病急、传染性强、致死率高的传染病,对我国的水禽生产造成了巨大的损失。然而目前对病毒感染过程中机体的应答机制和分子机制仍不明确,鸭对DHV感染的应答基因至今仍不清楚。
试验应用抑制性消减杂交技术成功地构建了雏鸭肝炎病毒侵染下肝脏消减cDNA文库,从消减cDNA文库中随机挑取768个cDNA克隆,经PCR筛选与斑点杂交鉴定,正向库384个点杂交共筛选出222个阳性克隆,反向库384个点杂交共筛选出77个阳性克隆。299个阳性克隆均测序获得299个差异表达的EST,299个ESTs在NCBI数据库中检测到70个差异表达的基因,包括SPEN、WSB1、HSP90等52个上调表达的基因和ALB、TLR6、TLR7等18个下调表达的基因。聚类分析结果表明筛选出的ESTs,12%与DNA复制合成相关,12%参与脂肪酸代谢,48%与药物、毒物、金属离子和吡哆醛磷酸盐等胁迫条件下异常生命调节活动相关,3%与蛋白质螯合相关,另25%参与生命体活动的其他调节作用。
