北京鸭肌肉生长抑制素基因多态性与胴体性状的关联分析
侯水生 研究员
用Z2、Z4、Z2×Z4等3个品系北京鸭各100只,以肌肉生长抑制素(MSTN)基因作为肌肉和脂肪性状相关的候选基因,进行了MSTN基因5′调控区及编码区性多态与胸肌发育相关指标的关联分析,同时对鸭MSTN基因3′-UTR进行了克隆。研究结果如下:
(1)针对3个不同品系的北京鸭(Z2系、Z4系、Z2×Z4杂交后代)MSTN基因5′调控区和编码区,设计了11对引物进行PCR-SSCP分析。发现其中2对引物的扩增片段具有多态性。引物D1/D2扩增片段的多态性由3个核苷酸的突变而产生:G→A(-753位),A→G(-737位),G→T(-658位),相对于起始密码子ATG;引物F1/F2扩增片段的多态性由-253位G突变为C所致。经过测序发现,D1/D2扩增片段的多态与F1/F2扩增片段的多态紧密连锁。
(2)对不同品系北京鸭进行群体遗传学分析表明,5′调控区引物的D1/D2扩增片段多态性在Z2和Z4两个纯系的基因型频率分布与Z2×Z4杂交后代之间存在一定的差异:Z2和Z4两个纯系中没有发现NN型和SS型;Z2×Z4杂交后代中NN型和SS型极少,仅占5%。但是在这3个系中的基因频率差异不大:3种品系均以等位基因M和R为优势基因。卡方适合性检验表明,北京鸭Z2、Z4、Z2×Z4杂交后代群体的MSTN基因的5′调控区位点,均处于Hardy-Weinberg非平衡状态。
(3)用最小二乘法对MSTN基因5′调控区的单核苷酸多态性与胴体重、胸肌重、胸肌率、腿肌重、腿肌率、全净膛重、皮脂重、皮脂率、腹脂重、腹脂率等性状进行方差分析,结果表明:北京鸭Z2系MM和RR型腹脂率(P<0.05)、胸肌率(P<0.10)显著高于MN和RS型;北京鸭Z4系MM和RR型胸肌率(P<0.10)显著高于MN和RS型;Z2×Z4杂交后代MM和RR型腹脂率(P<0.05)、胸肌率(P<0.10)显著高于MN、RS型和NN、SS型。
(4)克隆了部分鸭MSTN基因3′-UTR,碱基序列长度为321 bp。并对克隆的区段进行了PCR-SSCP检测,但没有发现多态性。
