半番鸭羽色候选基因MC1R基因的SNP多态性与羽色相关分析
陈晖 研究员
研究表明:黑素皮质激素受体1(MC1R)基因是与动物皮毛色素沉积量有关的候选基因。本研究首先克隆了半番鸭和北京鸭MC1R基因序列片段,其长度均为900 bp,共编码299个氨基酸。这两个基因序列均已成功登录GenBank,登录号分别为:EU877265和EU877264。其次,利用PCR-SSCP方法和直接测序相结合对羽色表型极端(全黑和全白)的半番鸭及其母本个体进行基因分型和SNP多态位点检测,结果显示,半番鸭群体MC1R基因存在5个SNP突变位点:A-G(141位)、G-A(162位)、A-G(331位)、G-A(364位)和A-G(399位),并对应9种基因型:AA、BB、AB、CD、DE、CE、CF、DF和EF;母本群体MC1R基因存在2个SNP突变位点:A-G(331位)、G-A(364位),对应3种基因型:DD、FF和DF。卡方检验表明:连锁位点A331G和G364A与半番鸭及其母本羽色表型极显著相关(P<0.01),而其他3个SNP多态位点均与半番鸭羽色表型无显著相关(P>0.05)。因此,MC1R基因可能是半番鸭羽色性状的主效基因或者与控制半番鸭羽色性状的主效基因连锁。
